佐世保商工会議所の議員は、会員の中から選任され、商工会議所の運営に直接参画し、地域経済、産業の発展を図るための各種事業を推進し、商工業の振興と地域社会の発展に尽力する重要な役割を担っています。議員は、各業界の代表として公正な立場で商工業の振興のために会員の意思をまとめ、政策の提言、商工会議所の組織、事業の運営全般に携わります。「1号議員」、「2号議員」、「3号議員」で構成され、第30期より定数が80名から110名に拡大されます。